一般佛寺所奉祀的藥師佛其實是藥師七佛之中的藥師琉璃光如來，其他六佛衹是書寫法名或是以相同相貌的六尊小佛像奉祀。藥師七佛的法名如下：善名稱吉祥王如來，寶月智嚴光音自在王如來，金色寶光妙行成就如來，無憂最勝吉祥如來，法海雷音如來，法海勝慧游戲神通如來，藥師琉璃光如來。
身爲東方教主的藥師如來佛，除了有左脅日光及右脅月光兩個菩薩陪侍之外（合稱東方三聖），還有十二位神將作爲部屬。
日光菩薩、月光菩薩與藥師佛的關係甚深。在久遠的過去世，電光如來行化世間。當時有一位梵士，養育二子。發菩提心，誓願拯救病苦眾生。當時的電光如來對之甚為讚嘆，勸梵士改名號為醫王，二子改名為日照、月照。這位受電光如來咐囑的梵士，成佛之後就是藥師佛。二位子嗣也就是兩大脅侍：日光菩薩、月光菩薩。當時的日照，就是後來的日光菩薩，月照，就是後來的月光菩薩。
十二神將為藥師佛之部屬，又稱十二神王或十二藥叉大將，，即守護誦持藥師經者之十二夜叉神將；或以其為藥師佛之分身。每一神將各擁有七千藥叉，合計為八萬四千護法神。
或謂十二神將於晝夜十二時、四季十二個月輪流守護眾生，若以地十二支逆配十二神將，則宮毘羅屬亥，伐折羅屬戌，招度羅屬丑，毘羯羅屬子等。又有將十二藥叉分為十二地支或十二生肖，將於晝夜十二時四季十二個月輪流守護眾生。其配屬關係表解如下：
子－肖鼠，丑－肖牛，寅－肖虎，卯－肖兔，辰－肖龍，巳－肖蛇，午－肖馬，未－肖羊，
申－肖猴，酉－肖雞，戍－肖狗，亥－肖豬。
日本佛寺的十二神將
茲根據《藥師觀行儀軌》將各神將之名稱、形像，及所持物等略述如下﹕
一、毘羯羅大將：
又作毘伽羅。意為圓作．身紅色．手持寶輪（子神）。此大將的本地為釋迦如來的名號，是子時之守護神。另有説法爲通身青色，現忿怒形，頭戴鼠冠，右手下垂持三鈷，左手作拉右袖之形態。
二、招杜羅大將：
又作朱杜羅、照頭羅。意為動身．身有色．手持寶鎚（丑神）。此大將的本地為金剛手菩薩，是丑時之守護神。另有説法爲通身赤色，現忿怒形，頭戴牛冠，右手把橫劍，左手開掌執劍尖。
三、真達羅大將：
又作真持羅。意為執想．身黃色．手持絹索（寅神）。此大將的本地為普賢菩薩，是寅時之守護神。另有説法爲現笑怒容貌，頭戴虎冠，右手持寶珠，左手把寶棒。
四、摩虎羅大將：
又作薄呼羅、摩休羅。意為執言．身白色．手持寶斧（卯神）。此大將的本地為藥師如來，是卯時之守護神。另有説法爲通身青色，稍作忿怒相，頭發赤色上聳，頭戴兔冠右手做拳當腰，左手持斧。
五、波夷羅大將：
又作婆耶羅。意為執飲．身紅色．手持寶鎚（辰神）。此大將的本地為文殊菩薩，是辰時之守護神。另有説法爲身呈白肉色，容貌忿怒，頭戴龍冠，右手屈臂，作拳攜矢，左手持弓。
六、因達羅大將：
又作因陀羅。意為執力．身紅色．手持寶棍（巳神）。此大將的本地為地藏菩薩，是已時之守護神。另有説法爲通身赤色，頭戴蛇冠，右手屈肘開掌，置于胸邊，左手持三股戟。
七、珊底羅大將：
又作娑儞羅、素藍羅。意為居處．身煙色．手持螺貝（午神）。此大將的本地為虛空藏菩薩，是午時之守護神。另有説法爲通身赤色，現忿怒形，頭戴馬冠，右手把三股戟，左手持螺具。
八、頞你羅大將：
又作末爾羅、摩尼羅。意為執風．身紅色．手持寶矢（未神）。此大將的本地為摩利支天，是未時之守護神。另有説法爲通身白色，現忿怒形，頭發上聳，頭戴羊冠，右手持箭羽，左手持矢根，將此箭彎成弓形。
九、安底羅大將：
又作頞儞羅、安捺羅、安陀羅。意為執星．身綠色．手持寶珠（申神）。此大將的本地為觀世音菩薩，是申時之守護神。另有説法爲通身赤色，現大忿怒形，頭戴猴冠，右手屈肘于右胸前開掌向前，屈左手，開掌，掌上放寶珠。
十、迷企羅大將：
又作彌佉羅。意為執嚴．身黃色．手持獨鈷（酉神）。此大將的本地為阿彌陀如來，是酉時之守護神。另有説法爲通身赤色，現忿怒形，頭戴雞冠，右手持獨鈷，左手作拳押下腹部。
十一、伐折羅大將：
又作跋折羅、和耆羅。意為金剛．身白色．手持寶劍（戍神）。此大將的本地為勢至菩薩，是戍時之守護神。另有説法爲通身青色，現忿怒形，頭發茂盛聳上，頭戴狗冠，右手持劍，左手作拳當腰。
十二、宮毘羅大將：
又作金毘羅。意為極畏．身黃色．手持寶杵（亥神）。此大將的本地為彌勒菩薩，是亥時之守護神。另有説法爲通身赤色，現忿怒形，頭戴豬冠，右手持大刀橫于頭上，左手開掌當腰。
左側相片取自網路，右側相片爲本人在樹林吉祥寺所拍攝。
http://www.bgvpr.org/ex/1/ex_55.htm 藥師如來佛的專業網站
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